Sınırlı sayıda embriyonun alındığı Fish PGD (Floresan in situ hibridizasyon) yönteminde hücrelerden elde edilen DNA örnekleri incelenir. ACGH yöntemine göre daha limitli sayıda kromozom üzerinde yapılan bu inceleme %70-80 ortalamasında güvenilirlik barındırır. Genellikle en sık görülen 9 kromozom probleminin araştırıldığı bir genetik tanı incelemesidir.  Fish PGD yöntemi genellikle yeni nesil dizileme (NGS) ya da farklı genetik tanı incelemelerinin mümkün olmadığı kişilerde tercih edilmektedir.